El Convento de San Francisco de Asís fundado a finales del siglo XVI en 1575, constituyó el elemento distintivo de la presencia de la Orden Franciscana en el continente americano, quienes tenían como responsabilidad la evangelización de los pobladores de América. Este primer edificio fue demolido en 1719 cuando se inició la construcción del que aún existe y que fuera concluido en 1738; erigido por Fray Juan Romero cuya torre, la más alta de la época (42 metros), fue obra de arquitecto José Arcés. En 1739 quedó consagrada por el obispo franciscano Juan Luis Lazo de la Vega y Cancino con rango de Basílica Menor, adjunta en su tiempo a la Basílica San Giovanni Laterano en Roma. Su celebridad hizo que la plaza lateral a este convento franciscano llevará su nombre y hasta hoy sea conocida como Plaza de San Francisco de Asís o de San Francisco.
Se encuentra ubicado en el casco histórico de la capital cubana, nominada por la UNESCO como Patrimonio de la Humanidad.